A coordenação didática do Programa é exercida por um Colegiado, constituído de cinco representantes dos professores que colaboram no curso e um representante dos alunos, com mandatos de dois anos e um ano respectivamente.
O Colegiado elege, dentre seus membros representantes dos professores, um coordenador, com mandato de dois anos.
Atualmente, o Colegiado está sob a coordenação do Prof. José Irineu Rangel Rigotti.
Integram também o Colegiado os professores Ana Paula de Andrade Verona (Subcoordenadora), Simone Wajnman, Bernardo Lanza Queiroz e Luciana Soares Luz do Amaral, além dos representantes discentes.